Un año después de su lanzamiento, Nintendo lo colocó en su etiqueta de marketing Player’s Choice. En Japón, Super Metroid fue el noveno videojuego más vendido de 1994 con 531.000 copias vendidas ese año. Super Metroid recolectó varios premios y honores. Nintendo Power lo nombró el mejor juego de la serie Metroid, chaqueta psg jordan superando a Metroid Prime y Metroid: Zero Mission.
